Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER1283	HE591606	84488	84768	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER1566	HE591606	480491	480764	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER1783	HE591614	52381	52804	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER1930	HE591614	185617	185791	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER2653	HE591633	315356	315701	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER2716	HE591633	418135	418577	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER5242	HE591693	251751	251964	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER6709	HE591724	144204	144495	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER6711	HE591724	145525	145898	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER6883	HE591724	339644	340071	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER6930	HE591724	373275	373426	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER8716	HE591737	21195	21517	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER9162	HE591740	27673	27958	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER9489	HE591741	338046	338448	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER9501	HE591742	20985	21352	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER9679	HE591742	209714	209881	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER10218	HE591746	148254	148381	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER10746	HE591749	156606	156910	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER14386	HE591772	9679	10052	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER14389	HE591772	10601	10729	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER14539	HE591772	145764	146053	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER14914	HE591773	256168	256463	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER15013	HE591775	5063	5480	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER15791	HE591784	28973	29261	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER16100	HE591785	139731	139827	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER16883	HE591791	160440	160595	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER16899	HE591791	199736	199884	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER16971	HE591792	22956	23114	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER17723	HE591797	10054	10142	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER18926	HE591805	21298	21584	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER20275	HE591816	156505	156925	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER20299	HE591816	177545	177670	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER20307	HE591816	186960	187252	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER20627	HE591819	3332	3616	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER22310	HE591834	178732	179115	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER22349	HE591835	22923	23088	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER23152	HE591843	119240	119407	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER24718	HE591855	160405	160744	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER25191	HE591859	150734	150851	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER25204	HE591859	164573	164772	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER25371	HE591861	3344	3609	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER25638	HE591863	42998	43137	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER25639	HE591863	43341	43497	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER26139	HE591869	59510	59752	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER26454	HE591872	46598	46709	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER27724	HE591887	2090	2286	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER27828	HE591887	100727	101174	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER27834	HE591887	103619	103796	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER29106	HE591907	95387	95574	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER29148	HE591908	11710	11846	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER29177	HE591908	38268	38422	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER29361	HE591910	117424	117853	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER29913	HE591920	107211	107337	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER30600	HE591929	90379	90495	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER30742	HE591931	65924	66240	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER31416	HE591943	94997	95047	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER31424	HE591943	98687	98876	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER31745	HE591949	59569	59669	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER32027	HE591954	80498	80637	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER32680	HE591966	18991	19189	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER33683	HE591981	76802	76911	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER34781	HE592003	57204	57448	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER35017	HE592009	49798	50061	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER35635	HE592025	66928	67095	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER35721	HE592028	20221	20438	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER36447	HE592045	41955	42391	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER36939	HE592058	40987	41362	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER37256	HE592067	19211	19392	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER37949	HE592089	48053	48309	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER38557	HE592115	8660	8953	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER38686	HE592120	40491	40954	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER39539	HE592156	34041	34109	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER39540	HE592156	34128	34427	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER39716	HE592168	32521	32597	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER40450	HE592233	1964	2197	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER40468	HE592235	391	560	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER41314	HE592373	28202	28280	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER41623	HE592387	29064	29352	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER43285	HE592480	7371	7473	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER43287	HE592480	7716	7884	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER43520	HE592492	3270	3446	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER43532	HE592492	18975	19120	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER44269	HE592547	17137	17346	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER44606	HE592574	4952	5329	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER44669	HE592578	2243	2427	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER44703	HE592579	8507	8622	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER44733	HE592581	9220	9369	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER45042	HE592610	13455	13500	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER45342	HE592639	528	587	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER45343	HE592639	580	681	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER45841	HE592693	300	489	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER45860	HE592694	10202	10332	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER46233	HE592729	2649	2765	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER46236	HE592729	12333	12615	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER46880	HE592795	2326	2608	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER47045	HE592806	1239	1391	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER47213	HE592823	10348	10424	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER47281	HE592829	10787	10858	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER48523	HE592987	2719	3004	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER48622	HE592998	3203	3279	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER49333	HE593092	10689	11124	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER49554	HE593124	241	664	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER51134	HE593361	5889	5949	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER51254	HE593378	8180	8310	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER51684	HE593435	4555	4746	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER52345	HE593530	3658	3827	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER52745	HE593595	621	1051	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER52750	HE593595	3048	3383	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER52782	HE593600	1520	1802	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER52913	HE593629	4541	4689	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER52945	HE593636	1852	2020	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER54180	HE593856	2410	2754	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER54997	HE594017	7014	7322	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER55521	HE594126	6179	6459	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER55594	HE594145	458	776	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER58988	HE595031	5247	5307	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER59452	HE595151	2961	3145	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER59795	HE595249	3733	3964	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER60301	HE595421	5135	5550	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER61250	HE595749	87	521	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER61254	HE595749	1791	1863	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER61705	HE595890	3306	3614	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER62222	HE596025	1594	1762	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER62772	HE596160	278	446	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER63474	HE596335	1852	2151	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER63693	HE596397	1318	1437	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER65724	HE597051	2944	3074	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER65860	HE597090	1797	1979	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER65861	HE597090	2946	3114	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER66883	HE597435	501	783	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER68733	HE598179	838	939	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER68904	HE598253	8	111	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER69079	HE598328	1713	1881	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER74251	chr1	9469528	9469746	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER78451	chr1	18378952	18379354	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER80466	chr10	9948	10377	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER84046	chr10	7753053	7753232	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER84658	chr10	8963168	8963243	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER85970	chr11	2109018	2109201	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER97045	chr13	2034684	2034949	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER97371	chr13	2503258	2503576	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER97908	chr13	3241861	3242151	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER98144	chr13	3592156	3592320	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER98429	chr13	3889492	3889901	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER99969	chr13	6657896	6658043	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER105803	chr14	2141558	2141694	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER108093	chr14	7376811	7376923	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER108273	chr14	7774897	7775280	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER110984	chr15	1633039	1633235	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER110987	chr15	1637430	1637748	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER111268	chr15	1956536	1956682	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER113295	chr15	5838923	5839250	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER113319	chr15	5907204	5907531	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER115983	chr16	471525	471665	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER122592	chr17	3137211	3137646	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER123583	chr17	4592812	4593251	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER127704	chr18	746740	746941	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER131609	chr19	308391	308496	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER131807	chr19	600708	601102	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER132093	chr19	982564	982770	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER132329	chr19	1321042	1321149	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER132481	chr19	1534299	1534460	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER132775	chr19	1807155	1807318	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER133611	chr19	3025138	3025237	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER136151	chr19	8413130	8413552	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER139123	chr2	467829	468134	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER139140	chr2	476382	476766	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER139664	chr2	1036748	1037018	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER139756	chr2	1200358	1200735	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER139859	chr2	1363002	1363442	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER139923	chr2	1441837	1442119	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER139977	chr2	1494771	1495057	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER144649	chr20	456250	456454	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER144650	chr20	456523	456570	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER145806	chr20	3042882	3043046	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER145807	chr20	3043061	3043257	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER147609	chr20	6535880	6535974	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER148803	chr20	9129489	9129596	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER151129	chr21	789086	789204	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER151414	chr21	1411438	1411886	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER151417	chr21	1413821	1414156	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER155964	chr21	10492823	10493105	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER159497	chr22	3396674	3397109	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER160543	chr22	4828711	4829002	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER160581	chr22	4862726	4863131	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER160661	chr22	4980342	4980763	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER160786	chr22	5119004	5119124	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER160897	chr22	5256100	5256374	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER161310	chr22	5761960	5762142	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER161784	chr22	6393683	6394095	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER165524	chr3	2024680	2024755	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER165525	chr3	2024745	2024876	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER165974	chr3	2639740	2639928	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER166125	chr3	2805310	2805610	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER166128	chr3	2806943	2807093	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER172405	chr4	2227030	2227381	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER179755	chr5	2375603	2376059	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER180387	chr5	3177041	3177211	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER180388	chr5	3177225	3177354	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER184861	chr6	240818	240917	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER185621	chr6	1288484	1288860	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER187801	chr6	6534954	6535251	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER189325	chr7	416910	417341	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER191094	chr7	3218529	3218747	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER191166	chr7	3289748	3290027	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER191311	chr7	3415027	3415107	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER191319	chr7	3423350	3423736	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER196747	chr7	14237656	14237933	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER197233	chr8	502453	502644	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER197423	chr8	766567	766732	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER198767	chr8	3630573	3630619	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER200294	chr8	6968343	6968694	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER202137	chr8	10171169	10171445	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER202150	chr8	10195188	10195404	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER202580	chr8	10964051	10964101	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER202582	chr8	10967569	10967619	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER202585	chr8	10968575	10968718	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER202587	chr8	10968749	10968771	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER205746	chr9	3625866	3626177	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER205748	chr9	3626545	3626717	0	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER206026	chr9	4139308	4139467	1	LTR
Ronin3_LTR|LTR|Gypsy-HOMER206027	chr9	4139469	4139581	1	LTR
